Решением Совета глав правительств Содружества Независимых Государств в 2014 году Институт Наследия был наделён статусом Базовой организации государств — участников СНГ. В функции Базовой организации входит содействие многостороннему взаимодействию государств — участников СНГ в области сохранения всемирного наследия и повышения эффективности выполнения Конвенции об охране всемирного культурного и природного наследия 1972 года на территориях этих государств.
В рамках этой работы Институт Наследия ежегодно проводит Международный конгресс «Всемирное наследие стран СНГ». В 2019 году в рамках конгресса состоялось учредительное заседание экспертного совета при Базовой организации. Председателем Экспертного совета на 2020 год избрана начальник управления по охране историко-культурного наследия Министерства культуры Республики Беларусь Наталья Хвир.
На заседании Экспертного совета 1 декабря 2020 года председателем на 2021 год избрана директор Республиканского государственного историко-культурного музея-заповедника «Бозок» Министерства культуры и спорта Республики Казахстан Сауле Бурбаева.
На заседании Экспертного совета 15 декабря 2021 года председателем на 2022 год избран главный специалист Управления сохранения и развития культурного наследия Министерства культуры, информации и туризма Кыргызской Республики Чынарбек Жолдошев.
На заседании Экспертного совета 26 декабря 2022 года председателем на 2023 год избран директор Российского научно-исследовательского института культурного и природного наследия имени Д.С. Лихачёва Владимир Аристархов.